Exeter memenangkan gelar liga pertama mereka pada musim 1989-90 dan promosi sebagai juara Divisi Keempat di bawah kepemimpinan Terry Cooper.
Exeter City sempat terdampar di kasta terendah sepak bola Inggris di liga confrence.
Setelah berjuang keras, Exeter City akhirnya bisa kembali ke kasta Football League dan hingga kini bermain di League One.
Hingga pekan ke-16 League One, Exeter City saat ini duduk di peringkat 20 dengan mengemas 17 poin.